El dos de diciembre de 1573, Pedro Ruiz de Alarcón hace valer su hidalguía en la Chancillería de Granada frente al concejo de Vara de Rey como descendiente del doctor Pedro González del Castillo y los Ruiz de Alarcón. Pedro Ruiz de Alarcón había nacido en Sisante, aunque había aprendido a leer y escribir con el clérigo Bernardino García en el lugar de Olivares. Luego, tras casarse en Granada, había vuelto a Sisante, si bien pasaba largas temporadas en el molino y batán del Licenciado, propiedad familiar en el Castillo de Garcimuñoz. El núcleo de sus propiedades estaban en la dehesa de la Olivilla. Su padre Pedro Ruiz de Alarcón se había significado en la represión de las Comunidades al servicio del comendador de Santiago Tristan Ruiz de Molina:
e le avía visto venir en tienpo de las comunidades y estar e posar en tienpo de las dichas comunidades en la dicha villa de Castillo de Garcimuñoz en casa en casa del comendador Tristán Ruyz de Molina
El padre Pedro se había casado con Leonor de Mendoza, hija del señor de Minaya, Rodrigo Pacheco y su mujer Mencía de Mendoza, su vida transcurría en la casa familiar de Sisante hasta que en 1525 participa en la guerra del Peñón de Vélez Gomera junto al marqués de Mondéjar; allí muere. El abuelo era Pedro González del Castillo, pero a partir de aquí la genealogía oficial que nos da la familia Ruiz de Alarcón se rompe, pues se salta a Alonso como bisabuelo para hacer del licenciado Hernán González del Castillo el bisabuelo real.
Quien nos relata la genealogía de Pedro Ruiz de Alarcón es el hidalgo Juan Núñez de Avendaño que vivía en las casas de Castillo de Garcimuñoz pertenecientes al doctor Pedro González del Castillo y que para comprarlas había obtenido licencia de Fernando el Católico, pues estaban vinculadas a mayorazgo. Este hidalgo nos relataba así su conocimiento del doctor Pedro, por lo que había oído a Alonso Álvarez de Toledo, señor de Cervera, y a su tío Diego Núñez
El doctor Pedro González de Castillo que hera oydor y rrefrendario del señor rrey don Juan y su alcalde chanciller cuyas fueron las dichas villa de Santa María del Canpo e Santiago de la Torre avía avido por su hijo natural en una donzella que tenía en su casa al dicho licenciado Hernán Gonçález del Castillo siendo el dicho dotor Pedro Gonçález soltero por casar e la madre del dicho licenciado Hernán Gonçález soltera y sin tener ynpedimiento alguno para poder se casar anbos e que como su hijo natural lo avía tenido e nonbrado e avía hecho en él mayoradgo de la dicha villa de Santa María del Campo e de Santiago de la Torre y lo avía casado como su hijo natural y que después siendo ya viejo el dicho doctor Pedro Gonçález del Castillo se avía casado e avía avido un hijo legítimo que se llamava Juan del Castillo Puertocarrero e que siendo de edad de siete años el dicho Juan del Castillo Puertocarrero avía hecho el dicho dotor Pedro Gonçález del Castillo en él el mayoradgo que primero avía hecho en el dicho licenciado Hernán Gonçález del Castillo su hijo natural y lo avía desmancipado para que goçase dél en su vida y que en rreconpensa dello le avía dado al dicho licenciado Hernán Gonçález del Castillo su hijo natural a la dicha villa de Albaladexo del Cuende y al heredamiento de la casa de don Benito en término de la dicha villa de Castillo de Garcimuñoz e los molinos que se dezían e nonbraban del licenciado y la dehesa y heredamiento que el dicho Pedro Ruiz de Alarcón poseya de presente en el dicho lugar de Sisante y la casa que dizen de la torre de San Clemente
Juan Núñez confundía algunas de las donaciones del doctor Pedro y le otorgaba otras de su hermano, el corregidor Hernán, como la Torre Vieja, pero no mentía en el hecho de que el doctor Pedro en 1445 con motivo de su testamento había fundado nuevo mayorazgo en favor de su hijo legítimo Juan y había desgajado de la hacienda y quitado a su hijo natural Hernán Santa María del Campo Rus y Santiago de la Torre. Para poner orden en los dichos, el presbítero Alonso González Andújar, que añadía que había otro Hernán González del Castillo, hermano del doctor Pedro y que había sido corregidor en Asturias, del que habían quedado la torre y casas que en medio del pueblo tenía, seguramente casa fuerte, tal como la arqueología indica. Alonso González Andújar era capellán de la capilla fundada por Hernán González del Castillo en la iglesia de Santiago de San Clemente
e que el dicho dotor Pedro Gonçález del Castillo avía tenido un hermano que se llamava Hernán Gonçález del Castillo que avía sido corregidor en Asturias y en otras partes e que avía hecho en la villa de San Clemente las casas y torre que estavan en medio de la dicha villa que llamavan la torre vieja
Junto a la Torre Vieja, estas casas aledañas todavía estaban en pie a comienzos del siglo XVI, pues sabemos que en ellas vivía Pedro Ruiz de Alarcón (nieto del doctor Pedro), junto a su mujer Leonor de Mendoza, hija de Rodrigo Pacheco y Mencía Mendoza, señores de Minaya. Sobre el carácter de casa fuerte de esta construcción es difícil aventurar, aunque parece lo más lógico al tratarse de edificación aneja y existir en los comienzos del Quinientos en ese lugar una calle llamada de las Almenas, que fue el primer lugar donde se instalaron los mercaderes y recordarnos ese hecho la casa de los Valdeguerrero con su muro almenado.
El licenciado Hernán González del Castillo había casado con Guiomar Alarcón, hija de Pedro Ruiz de Alarcón, señor de Buencahe. Del matrimonio había nacido Pedro Ruiz de Alarcón el viejo, que había casado con doña María Carrillo, hija de Juan Álvarez de Toledo y doña Leonor Cuello, señores de Cervera, ambos habían vivido en el heredamiento de Cañada Negrilla (o Negrita) y había procreado a Pedro Ruiz de Alarcón, padre del que litigaba. Al morir, tanto Pedro como María Carrillo habían sido enterrados en la capilla familiar de Santa Catalina, de la iglesia de San Juan de Castillo de Garcimuñoz.
Pero Juan Núñez Avendaño advocaba además la genealogía familiar del doctor Pedro González del Castillo que se remontaba al fundador Clemén Pérez de Rus, que estaba enterrado en la capilla de San Antonio de la iglesia de San Clemente:
que el dicho dotor Pedro Gonçález del Castillo rrebisabuelo del que litigava hera honbre hijo de Alfonso Martínez del Castillo y este testigo descendía a quarto abuelo de Clemén Pérez de Rrus primero fundador de la villa de San Clemente el qual estava enterrado en la capilla de San Antonio de la dicha villa de San Clemente que es la advocación del señor Santiago yglesia mayor de la dicha villa de san Clemente el qual avia puesto su nombre al dicho pueblo por avello él fundado e que se llamava él Clemén Pérez de Rrus por otro nonbre que hera señor del castillo de Rrus que de presente estava derrivado e que él e sus subcesores avían servido sienpre a los señores rreyes de Castilla e questa genealogía la avía leydo este testigo en un protologo que tenia don Luis Girón y Alarcón señor de la villa de Albaladexo del Cuende
Las confusiones con Clemén Pérez de Rus eran comunes en otros testigos, como el bachiller Juan León Campuzano, en este caso, se le tenía por el que había levantado la Torre Vieja, asimilando la primera casa del fundador del pueblo con esta ubicación
Clemén Perez de Rrus que avía sido de la casa e castillo de Rrus primero fundador y poblador de la villa de San Clemente que en ella primero avía hecho fundación y casa en una torre grande que aún de presente se dezía torre vieja
Otros, como Diego López de Haro, no daban más veracidad a esta genealogía que el haberlo oído decir a otros
La ejecutoria de hidalguía es de 28 de abril de 1578
ACHGR, HIDALGUÍA, SIGN ANT 301-63-16
Probanza de 1574
Juan Núñez de Avendaño, vecino de Castillo de Garcimuñoz, hidalgo. 64 años
Fray Gregorio de Alarcón, fraile profeso en el monasterio de San Agustín, hijo de hijodalgo y de 66 años, hijo de Pedro López de Alarcón, escribano del Castillo de Garcimuñoz, y Ana Vives de Arboleda
El bachiller Juan de León Campuzano, clérigo presbítero, beneficiado en el lugar de Honrubia, 72 años
Diego López de Haro, hidalgo de San Clemente, 82 años, hijo de Hernán Vázquez de Haro
Alonso González de Andújar, presbítero de San Clemente, hombre llano, 83 años
Juan González de Origüela, pechero de San Clemente, 73 años es el hijo de Luis Sánchez de Origüela. Según su testimonio había muerto con 65 años: en su testimonio reconoce que Leonor Mendoza y Pedro Ruiz de Alarcón se habían mudado a vivir a San Clemente hacia 1515
Alonso de Sepúlveda, hidalgo de Vara de Rey, 85 años
Alonso de Montoya, presbítero de Vara de Rey, de familia de hidalgos
Simón Carrero el viejo, morador de Tébar, 90 años.
Hernando de Montoya, hidalgo de Minaya, 80 años
Pedro de Montoya, hidalgo de Villarrobledo y natural de Vala de Rey